ゲーム開始時、プレイヤーはビギナーズモード、スタンダードモード、エキスパートモードのいずれかを選択します。
なお、ガイダンスモードは、ゲームの基本操作や基礎知識が学べるショートシナリオです。この３つのモードは
ゲーム本編中のインターミッションのメニュー「オプション」で変更できます。
なお、どちらのモードを選んでも
ストーリー内容、登場する機体やパイロットは同じです。
ビギナーズモード
初心者の方やゲームを手軽にプレイしたい方向きのモードです。ＳＲポイント（各シナリオに１つずつ設定されているチャレンジ課題をクリアすると得られるポイント）の獲得条件がなく、難易度はノーマルで固定されます。また、戦闘マップをクリアするとボーナス資金とボーナスＴａｃＰが得られます。
スタンダードモード
このモードにはＳＲポイント獲得条件が存在し、ＳＲポイントの獲得状況によって難易度がノーマルとハードのどちらかに変化します。
エキスパートモード
熟練プレイヤーにお勧めのモードです。難易度がハードに固定され、敵もスタンダードモードに比べると改造度が高くなるなど手強くなっており、リトライすることなくシナリオをクリアすると、ＳＲポイントを獲得します。
