「スキルルート」で開発・生産した特殊スキルは、インターミッションのメニュー「スキルプログラム」の「スキル修得」で任意のパイロットに修得させることが出来ます。なお、特殊スキルはパイロット１人につき最大３０個まで修得可能です。

  ただし、画面写真にある「ブルーウォーターの加護」のように特定のパイロットが最初から修得している特殊スキルも複数存在していますが、それらは「スキルルート」で開発・生産することが出来ません。

  また、修得した特殊スキルはリスト内で並べ替えが可能です。